Espressione genetica

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Espressione genetica2019-03-14T11:48:49+00:00

Nanostring

– nCounters Molecules that count

La tecnologia brevettata di NanoString utilizzata nel sistema di analisi nCounter è una vera metodica di rilevamento digitale in grado di eseguire il  profiling diretto delle singole molecole in una sola reazione senza necessità di reazioni enzimatiche e con un elevatissimo grado di multiplex. Il principio si basa sulla marcatura di ogni singola molecola di acido nucleico target con un color coded- barcode unico.
La marcatura viene resa possibile, nel caso di DNA e RNA dall’ibridizzazione delle molecole di acido nucleico con sonde specifiche, mentre nel caso di Proteine dall’interazione con uno specifico anticorpo.Successivamente le sonde ibridizzate vengono spottate su fase solida nella cartuccia di analisi dedicata. Grazie all’elevato grado di automazione, il workflow è altamente semplificato e richiede un intervento da parte dell’operatore per un tempo complessivo di 15 minuti, massimizzando le performance del sistema e riducendo al minimo la possibilità di errore. Gli step di pipettamento richiesti per il set up sono 4. nCounter è una piattaforma completa che non richiede ulteriore strumentazione dedicata per poter lavorare diversa da quella convenzionalmente presente nel laboratorio di biologia molecolare.

nCounter System la soluzione per lo studio di espressione genica. Il nuovo sistema rapido e semplice, per lo studio della gene expression attraverso il rilevamento digitale di acidi nucleici (DNA, RNA) utilizzando un sistema completamente automatico sia nella fase di preparazione (Prep Station) sia nella fase di lettura (Digital Analyzer).

nCounter Sprint Profiler System

La Piattaforma è in grado di effettuare lo studio di 800 target, in contemporanea per campione, per analisi di espressione genica (mRNA e miRNA, Copy Number Variation (DNA) in modo completamente automatico e senza la necessità di amplificazione del segnale o l’esecuzione di una step di PCR. Questo permette di evitare gli inconvenienti normalmente derivanti dall’uso di sistemi enzimatici, come l’introduzione di bias e quindi la creazione di errori nelle sequenze di interesse. Nanostring rappresenta una delle metodiche più robuste attualmente sul mercato e permette di lavorare su materiale estratto anche da campioni altamente degradati come tessuto firssato in formalina ed incluso in paraffina (FFPE).
Lo strumento nCounter SPRINT Profiler opera in due fasi distinte. La prima fase utilizza un sistema di microfluidica multicanale per la purificazione dei complessi target-sonde, mentre elimina le sonde non legate. Questi complessi vengono poi immobilizzati e allineati su di una superficie della cartuccia che viene poi scansionata nella seconda fase di microscopia digitale. Le immagini risultanti vengono poi automaticamente interpretate per fornire all’utilizzatore le conte per ogni reporter barcode. Le due fasi avvengono all’interno dello stesso strumento.

  • Analisi da 20 a 800 geni per singola reazione

  • No PCR o amplificazione del segnale. Metodica basata su ibridazione e conta diretta delle molecole target.

  • Elevato grado di automazione: 10 minuti di totale hands on time

  • Possibilità di analizzare RNA-DNA-Proteine in un singolo tubo: 3D biology

  • Flessibilità applicativa: mRNA, miRNA, miRGE, CNV, single cell, Chip string, fusion genes, mRNA:Protein

  • Flessibilità nella tipologia di campioni

  • Elevate performance anche su lisati

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nCounter FLEX Analysis System

La prima e unica piattaforma in grado di effettuare lo studio di 800 target, in contemporanea per campione, per analisi di espressione genica (mRNA e miRNA), Copy Number Variation e SNV (DNA) e Proteine, in modo completamente automatico e senza la necessità di amplificazione del segnale o l’esecuzione di una step di PCR. Questo permette di evitare gli inconvenienti normalmente derivanti dall’uso di sistemi enzimatici, come l’introduzione di bias e quindi la creazione di errori nelle sequenze di interesse. Il sistema si compone di due parti strumentali:

nCounter Prep Station Strumento automatico per la purificazione del complesso molecola target-probe e successiva immobilizzazione nel supporto dedicato per la lettura. Tutti gli step vengono eseguiti in totale automazione, in ambiente chiuso, senza intervento dell’operatore.

nCounter Digital Analyzer Scanner automatico utilizzato per contare il numero di target differenziati sulla base di probe univoci per ogni singolo target studiato. Il risultato viene fornito in formato Excel per un’analisi immediata e semplice del dato.

  • Analisi da 20 a 800 geni per singola reazione

  • No PCR o amplificazione del segnale. Metodica basata su ibridazione e conta diretta delle molecole target.

  • Possibilità di testare multipli geni di riferimento per ogni singolo campione

  • Controlli positivi e negativi integrati nel codeset ed in ogni singola reazione

  • Elevato grado di automazione: 15 minuti di totale hands on time

  • Possibilità di analizzare RNA-DNA-Proteine in un singolo tubo: 3D biology

  • Flessibilità applicativa: mRNA Protein, SNV, miRNA, miRGE, CNV, single cell, Chip string, fusion genes, mRNA:Protein, Protein

  • Flessibilità nella tipologia di campioni (acidi nucleici estratti da FFPE, lisati cellulari, tessuti freschi, cellule, fluidi biologici)

  • Elevate performance anche su lisati

  • Nessun approccio bioinformatica richiesto per l’analisi del dato

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Loop Genomics

Loop Genomics è un service lab che ti permette di analizzare i tuoi dati senza il supporto di un bioinformatico.  Scegli il kit che fa per te, analizza i dati su piattaforma Illumina e ricevi il dato processato. Ogni kit viene fornito con tutti i reagenti necessari per ottenere dal DNA genomico estratto o dall’RNA una library pronta per il sequenzionamento.

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Takara Clontech

L’obiettivo di Takara Bio è fornire prodotti best-in-class di elevata qualità che permettano al ricercatore di superare eventuali problemi tecnici e
soffermarsi più attentamente allo sviluppo delle conoscenze scientifiche. L’ampio portfolio NGS di Takara Bio è dotato di una notevole sensibilità e riproducibilità
per soddisfare
tutte le tue esigenze nelle operazioni di sequenziamento, indipendentemente dal tipo di campione e dalla quantità del materiale in entrata.

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