Bruker Spatial Biology
La tecnologia brevettata di Bruker Spatial Biology utilizzata nel sistema di analisi nCounter è una vera metodica di rilevamento digitale in grado di eseguire il profiling diretto delle singole molecole in una sola reazione senza necessità di reazioni enzimatiche e con un elevatissimo grado di multiplex. Il principio si basa sulla marcatura di ogni singola molecola di acido nucleico target con un color coded- barcode unico.
La marcatura viene resa possibile, nel caso di DNA e RNA dall’ibridizzazione delle molecole di acido nucleico con sonde specifiche, mentre nel caso di Proteine dall’interazione con uno specifico anticorpo. Successivamente le sonde ibridizzate vengono spottate su fase solida nella cartuccia di analisi dedicata. Grazie all’elevato grado di automazione, il workflow è altamente semplificato e richiede un intervento da parte dell’operatore per un tempo complessivo di 15 minuti, massimizzando le performance del sistema e riducendo al minimo la possibilità di errore. Gli step di pipettamento richiesti per il set up sono 4. nCounter è una piattaforma completa che non richiede ulteriore strumentazione dedicata per poter lavorare diversa da quella convenzionalmente presente nel laboratorio di biologia molecolare.
nCounter System la soluzione per lo studio di espressione genica. Il nuovo sistema rapido e semplice, per lo studio della gene expression attraverso il rilevamento digitale di acidi nucleici (DNA, RNA) utilizzando un sistema completamente automatico sia nella fase di preparazione (Prep Station) sia nella fase di lettura (Digital Analyzer).
nCounter SPRINT Profiler System
La Piattaforma è in grado di effettuare lo studio di 800 target, in contemporanea per campione, per analisi di espressione genica (mRNA e miRNA, Copy Number Variation (DNA) in modo completamente automatico e senza la necessità di amplificazione del segnale o l’esecuzione di una step di PCR. Questo permette di evitare gli inconvenienti normalmente derivanti dall’uso di sistemi enzimatici, come l’introduzione di bias e quindi la creazione di errori nelle sequenze di interesse. Nanostring rappresenta una delle metodiche più robuste attualmente sul mercato e permette di lavorare su materiale estratto anche da campioni altamente degradati come tessuto fissato in formalina ed incluso in paraffina (FFPE).
Lo strumento nCounter SPRINT Profiler opera in due fasi distinte. La prima fase utilizza un sistema di microfluidica multicanale per la purificazione dei complessi target-sonde, mentre elimina quelle non legate. Questi complessi vengono poi immobilizzati e allineati su di una superficie della cartuccia successivamente scansionata, nella seconda fase di microscopia digitale. Le immagini risultanti vengono automaticamente interpretate per fornire all’utilizzatore le conte per ogni reporter barcode. Le due fasi avvengono all’interno dello stesso strumento.
nCounter Pro Analysis System
La piattaforma Bruker Spatial Biology nCounter Pro Analysis System rappresenta l’evoluzione della tecnologia nCounter, progettata per offrire analisi altamente multiplexate di espressione genica e proteica con precisione, sensibilità e riproducibilità elevate. Il sistema consente la quantificazione digitale diretta di centinaia di target simultaneamente per campione, includendo mRNA, miRNA e proteine, senza la necessità di amplificazione enzimatica o step di PCR.
L’approccio basato su conteggio digitale diretto elimina i bias tipicamente associati ai processi di amplificazione, riducendo la variabilità tecnica e migliorando l’accuratezza dei risultati. Questo permette di ottenere dati robusti e comparabili, particolarmente adatti ad applicazioni di ricerca traslazionale, immuno-oncologia e studi di biomarcatori.
Il sistema si compone di due moduli strumentali integrati:
nCounter Pro Prep Station
Strumento completamente automatico dedicato alla preparazione del campione. Esegue in totale automazione, purificazione dei complessi target-probe e la successiva immobilizzazione sul supporto di lettura. L’intero workflow si svolge in ambiente chiuso, minimizzando l’intervento dell’operatore e garantendo elevata riproducibilità.
nCounter Pro Digital Analyzer
Sistema di scansione e conteggio digitale progettato per identificare e quantificare i target mediante probe molecolari univoci. La tecnologia di imaging ad alta risoluzione consente un conteggio preciso e affidabile delle molecole, restituendo risultati immediatamente fruibili per l’analisi dei dati.
CellScape
Il CellScape System – CELLSCAPE di Canopy Biosciences, è una piattaforma per la proteomica spaziale avanzata ad elevato multiplex, basata su immunofluorescenza ciclica. Lo strumento consente analisi di un numero molto elevato di proteine su una singola slide, mediante cicli iterativi di staining e imaging, permettendo di espandere progressivamente il numero di marker analizzati, potenzialmente senza limiti. Grazie alla risoluzione a singola cellula e all’imaging ad alta definizione (≈182 nm/pixel), il sistema offre una quantificazione proteica estremamente precisa, ideale per studi complessi di fenotipizzazione cellulare.
La tecnologia HDR microscopy garantisce un ampio range dinamico, consentendo la rilevazione simultanea di target a bassa e alta espressione nello stesso campione, con misurazioni quantitative affidabili. L’approccio mIF ciclica, combinato con la tecnologia proprietaria EpicIF, assicura una rimozione efficiente del segnale fluorescente tra i cicli preservando epitopi e integrità del tessuto. CELLSCAPE supporta tessuti FFPE e campioni fresh frozen, offrendo elevata flessibilità sperimentale.
Il sistema utilizza anticorpi fluorescenti commerciali standard (strumento completamente aperto a qualsiasi chimica), risultando compatibile con migliaia di anticorpi disponibili già testati (>6000). L’automazione walk-away, resa possibile dalla microfluidica integrata per staining, imaging e rimozione del segnale, riduce al minimo l’intervento dell’operatore e migliora la riproducibilità. I dati generati sono facilmente integrabili con pipeline bioinformatiche e software di analisi esternidi terze parti.
CELLSCAPE rappresenta una soluzione strategica per applicazioni in immuno-oncologia, studi del microambiente tumorale, biomarker discovery & validation e, ricerca traslazionale.
CosMx SMI
CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) di Bruker Spatial Biology è una piattaforma di imaging molecolare avanzato progettata per l’analisi trascrittomica ad altissima risoluzione spaziale. Consente la misurazione dell’espressione genica a livello di singola cellula, rilevando simultaneamente centinaia o migliaia di target RNA, fino alla caratterizzazione dell’intero trascrittoma. Grazie alla risoluzione spaziale subcellulare e alla tecnologia di imaging multiplex ad elevata specificità e sensibilità, permette di ottenere una mappatura precisa dei trascritti direttamente nel contesto tissutale. Il sistema è compatibile con campioni FFPE e tessuti freschi congelati, risultando ideale per studi clinici e campioni provenienti da biobanchebiobanca. Gli algoritmi di segmentazione cellulare avanzata garantiscono un’identificazione accurata delle cellule anche in tessuti complessi, mentre le pipeline software dedicate supportano visualizzazione spaziale, clustering cellulare e analisi dell’eterogeneità tissutale. L’integrazione con dati multi-omici consente di combinare trascrittomica spaziale e proteomica, rendendo CosMx SMI uno strumento strategico per applicazioni in oncologia, neuroscienze, immunologia, ricerca traslazionale e biomarker discovery.
GeoMx Digital Spatial Profiler
Risolvere l’eterogeneità del campione
Il tradeoff tra Spatial information e high-plex
Comprendere l’eterogeneità tissutale è un aspetto fondamentale per rispondere alle domande chiave in ambito biologico nella ricerca traslazionale. L’attuale paradigma di analisi dei tessuti necessità un tradeoff tra analisi morfologica e high-plex, sacrificando così informazioni di valore o campioni preziosi.
GeoMxTM DSP – il tuo GPS per la biologia
Il GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) di Nanostring combina le migliori tecnologie di profilazione spaziale e molecolare grazie alla generazione di un’immagine del tessuto con una risoluzione a livello di singola cellula e profili di 10 – 1000 differenti RNA o proteine. Questa esclusiva profilazione spaziale, che combina dati di high-plex ed high-troughput, permette al ricercatore di valutare in modo rapido e quantitativo le implicazioni biologiche dell’eterogeneità nei campioni di tessuto.
Localizza le tue regioni di interesse
La selezione, basata su tecnologia ad illuminazione diretta e regolabile, consente di avere differenti modalità di profilazione dinamiche:
- Geometric Profiling: permette di valutare l’eterogeneità tissutale con forme geometriche standardizzate attraverso regioni di tessuto distinte;
- Rare cell Profiling: marker morfologici specifici per differenti tipi di cellule guidano la profilazione, rivelando la funzione di distinte popolazioni cellulari;
- Gridded Profiling: esegue una profonda mappa spaziale grazie ad un pattern a griglia regolabile;
- Segment Profiling: massimizza la cellularità utilizzando marker morfologici per identificare e profilare compartimenti biologici distinti all’interno di una ROI (Region of Interest);
- Contour Profiling: la regione d’interesse (ROI) illuminata consente di valutare come la prossimità influenza sia la risposta biologica che il microambiente locale attorno ad una struttura centralizzata.
Esplora i tuoi dati
Tracciabilità totale (100%), dalla profilazione dati alle immagini di tessuto: selezionando specifici dati di profilazione il tool GeoMX Data Analysis mostrerà in modo automatico l’immagine del tessuto corrispondente ad una ROI e vice versa.
GeoMX DSP fornisce un’interfaccia allineata alle esigenze del ricercatore
- Easy to streamline: integrazione facile e veloce tra data collection e analisi dati;
- Easy to analyze: i dati di imaging e profilazione sono sempre connessi tra di loro
- Easy to collaborate: accesso multi utente e in contemporanea ai dati.
Scopri il tuo biomarker
Contenuto flessibile e pre-verificato per soddisfare ogni esigenza di ricerca
I saggi GeoMX sono modulari e ottimizzati per una performance robusta attraverso i campioni. Seleziona un core di analisi e fino a 6 differenti moduli per analizzare un massimo di 96 target con un singolo vetrino. Il contenuto disponibile copre l’immunologia, l’immunoncologia, le patologie neurodegenerative e neuroinfiammatorie. Inoltre, ulteriori proteine o RNA definiti dall’utente possono essere inseriti grazie al Protein Barcoding Service e all’offerta di RNA custom.
Beacon
La famiglia di sistemi Beacon Optofluidic System di Bruker Cellular Analysis –Beacon Discovery, Beacon Quest, Beacon Select e The Beacon – rappresenta una piattaforma integrata per la gestione, coltura e analisi funzionale di cellule vive a livello di singola cellula. Basata sulla tecnologia optofluidica proprietaria, la piattaforma utilizza la luce per spostare e indirizzare le cellule all’interno di micro-camere (NanoPen), garantendo un controllo estremamente preciso senza stress meccanico.
Il sistema consente isolamento, monitoraggio dinamico e screening funzionale in tempo reale di migliaia di cellule in parallelo. Queste caratteristiche rendono possibile associare fenotipo e genotipo: ogni cellula può essere caratterizzata per la sua funzionalitàe successivamente recuperata manentendola vitale ai fini dell’ espansione o in alternartiva sequenziarne DNA o RNA per identificarne il genotipo. Il workflow integrato riduce manipolazioni manuali e, mentre l’elevata efficienza di isolamento e propagazione assicura l’ottenimento linee cellulari monoclonali
