NGS

NGS2019-11-13T17:24:58+00:00

Loop Genomics

Loop Genomics

Loop Genomics è un service lab che ti permette di analizzare i tuoi dati senza il supporto di un bioinformatico.  Scegli il kit che fa per te, analizza i dati su piattaforma Illumina e ricevi il dato processato. Ogni kit viene fornito con tutti i reagenti necessari per ottenere dal DNA genomico estratto o dall’RNA una library pronta per il sequenzionamento.

Loop genomics worfkflow

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Takara Clontech

SMARTer NGS

L’obiettivo di Takara Bio è fornire prodotti best-in-class di elevata qualità che permettano al ricercatore di superare eventuali problemi tecnici e
soffermarsi più attentamente allo sviluppo delle conoscenze scientifiche. L’ampio portfolio NGS di Takara Bio è dotato di una notevole sensibilità e riproducibilità per soddisfare tutte le tue esigenze nelle operazioni di sequenziamento, indipendentemente dal tipo di campione e dalla quantità del materiale in entrata.

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siTOOLs Biotech

SMARTer NGS
Ready-made riboPOOLS

L’identificazione di RNA scientificamente rilevanti attraverso l’utilizzo della Next Generation Sequencing dell’RNA (RNA-Seq) è spesso limitata dalle alte quantità di RNA ribosomiale che, in alcuni casi, è presente per oltre il 90% nelle reads ottenute. Tuttavia, le attuali soluzioni di RNA depletion posso essere molto costose e non mirate a determinate specie.

Per questo motivo nasce siTOOLs Biotech: la mission dell’azienda tedesca è quella di fornire una gamma di prodotti, flessibile ed economicamente accessibile, che consenta agli addetti di effettuare la deplezione dell’RNA ribosomiale da ogni specie (da human, a mouse fino ai batteri) in totale libertà.

riboPOOL

Il kit riboPOOL (Ribosomal RNA depletion pools) permette la rimozione dell’RNA ribosomale, in maniera estremamente flessibile, fornendo al ricercatore una selezione di riboPOOLs e, allo stesso tempo, gli consente di creare il suo riboPOOL personalizzato per soddisfare ogni specifica esigenza. L’elevata efficienza di riboPOOL e la sua tecnologia all’avanguardia rendono il kit ideale per lavorare su determinate specie e per semplificare le complessità del sequenziamento, con prestazioni da record: offre infatti una deplezione del 10% dell’ RNA in più rispetto alle attuali soluzioni in commercio.

Perchè scegliere riboPOOL?

  • Risultati specifici ed efficienza elevata

  • Versatile e adatto ad ogni specie

  • Prezzo ridotto rispetto alle soluzioni attualmente presenti sul mercato

  • Deplezione personalizzata dell’RNA

  • Applicabile all’RNA non poliadenilato

  • Ideale per applicazioni metagenomiche e per campioni contenenti più specie.

siPOOL

siPOOL

Il kit siPOOL, ideato per un silenziamento genico chiaro e mirato, è un prodotto semplice, intuitivo e applicabile a diversi tipi di cellula. Grazie alle sue caratteristiche è in grado di rimuovere effetti off-target e incrementare l’affidabilità e l’accuratezza dei risultati (Hannus et al., 2014).
Con algoritmi di progettazione proprietari, le sequenze di siRNA all’interno di siPOOL sono anche ottimizzate per ottenere la massima copertura dei trascritti, un’ibridazione efficiente e filtrata contro i paraloghi, consentendo un silenziamento genico estremamente efficiente e specifico. I siPOOL sono strumenti ideali nella scoperta di farmaci per la validazione del target e l’identificazione del target con librerie siPOOL personalizzate o pronte all’uso.

Perchè scegliere siPOOL?

  • Utilizzo semplice e veloce

  • Efficienza e specificità elevata

  • Fenotipo uniforme

  • Garanzia inclusa di validazione

  • Design personalizzato in base alle annotazioni più recenti

  • Purificato PAGE e non tossico

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Twist Bioscience

Loop Genomics
Loop Genomics

Soluzioni NGS per Target Enrichment

Ottieni una performance superiore con le soluzioni Twist Bioscience NGS Target Enrichment!

L’azienda fornisce kit modulari per la preparazione delle library e per il target enrichment intuitivi e semplici da utilizzare. Il sequenziamento mirato fa un importante passo avanti con un flusso di lavoro di arricchimento ottimizzato e una facile personalizzazione dei contenuti dei pannelli.

Twist Human Core Exome Kit

Performance eccezionali

  • Sonde double Stranded DNA con prestazioni precise, accurate ed ottimizzate grazie al probe boosting e ad una amplificazione efficiente;
  • Controllo qualità in NGS di tutte le sonde;
  • Arricchimento uniforme delle regioni target senza interruzioni impreviste e specificità senza precedenti anche a profondità di sequenziamento elevate.

Massima efficienza di cattura

  • Un’alta uniformità dei processi di enrichment significa che è possibile aumentare le profondità di sequenziamento o il throughput, riducendo fino al 50% i costi complessivi del sequencing.

Flessibilità maggiore

  • La struttura modulare dei kit permette una maggiore flessibilità del workflow per una facile integrazione nei protocolli già esistenti;
  • I tool personalizzati permettono un’implementazione rapida e modulabile degli esomi custom.

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Twist Custom Panels

Prestazioni incredibili

  • Double Stranded DNA probes con prestazioni ottimizzate, precise e accurate;
  • Controllo qualità in NGS di tutte le sonde.

Customizzazione rapida e semplice

  • Turnaround time ridotto per finalizzare il pannello (4 settimane dall’ordine);
  • Design scalabile da 100 a >1M sonde per pool.

Creazione del pannello intuitiva

  • Gli algoritmi, dotati di design proprietario, consentono una cattura bilanciata anche per le regioni più complesse;
  • Strumento dal design semplice ed efficace che permette una customizzazione del pannello facile e senza sforzi.

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Twist Library Prep Kits

Twist Library Preparation EF Kit (frammentazione enzimatica)

  • Ideale per una preparazione della library automatizzata e ad alta produttività;
  • Produce dimensioni di frammenti modificabili e riproducibili;
  • Riduce al minimo il sequence bias e massimizza la copertura della profondità.

Twist Library Preparation Kit (frammentazione meccanica)

  • Consente un’ampia gamma di tipologie di DNA input;
  • Permette un sequenziamento ad alta qualità anche per campioni di bassa qualità;
  • Minimizza artefatti start/stop.

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Twist Fixed Panels

Twist Human RefSeq Panel

Twist Pan-Viral Panel

Twist Mouse Exome Panel

Twist Fast Hyb & Wash Kit

Risparmio di tempo notevole

  • Processo di ibridazione in 15 minuti;
  • Workflow ottimizzato e veloce, può essere completato in 5-8 ore (preparazione della library compresa);
  • Dal campione alla sequenza in un giorno.

Copertura ottimale e flessibilità impareggiabile

  • Fornisce uniformità eccellente e tassi on-target migliori;
  • Il tempo di ibridazione può essere regolato per ottimizzare le performance;
  • Completamente automatizzabile per applicazioni ad alta produttività.

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Single Cell NGS

Mission Bio

Mission Bio Tapestri

Mission Bio ha sviluppato la prima ed unica piattaforma per Single Cell Targeted DNA Seq per soluzioni ad alto impatto nella medicina personalizzata.
Quando si studia o si cura il cancro, non si vuole perdere neanche una singola cellula. Qualsiasi cellula che dovesse rimanere dopo il trattamento può provocare una ricaduta. La piattaforma Tapestri® di Mission Bio è l’unica tecnologia che fornisce il sequenziamento del DNA specifico di una singola cellula con risoluzione su single-base.

Tapestri è la prima piattaforma di analisi del DNA a livello di singola cellula modulabile e personalizzabile del settore. La piattaforma di Mission Bio è stata sviluppata per aiutare a far progredire la medicina di precisione, consentendo la rilevazione accelerata e accessibile della variabilità genomica all’interno delle popolazioni cellulari. Sfruttando la microfluidica a goccia, la piattaforma consente di accedere al DNA a livello di singola cellula con un nuovo flusso di lavoro in due fasi che permette l’utilizzo di pannelli di ampliconi, anche custom. Questa metodologia offre flessibilità per ulteriori applicazioni e funzionalità di personalizzazione.

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Takara ICELL8

ICell8

Il sistema ICELL8 cx Single-Cell System e l’originale ICELL8 Single-Cell System (modulare) sono piattaforme aperte che consentono il trattamento di centinaia di singole cellule o nuclei, indipendentemente dalle dimensioni o dalla forma, e possono trattare fino a otto campioni in parallelo. Questo permette di correre più campioni e replicati nello stesso esperimento consentendo l’eliminazione degli effetti batch.
Il sistema sfrutta i vantaggi dell’imaging per distinguere i pozzetti contenenti una singola cellula da quelli vuoti o contenenti più cellule (riducendo così il background) fornendo un workflow automatizzato:

  • le cellule sono distribuite in uno SmartChip brevettato da 5.184 pozzetti;
  • le immagini vengono create per ogni nanowell nel chip;
  • le immagini acquisite vengono elaborate utilizzando il software CellSelect incluso, con una precisione >85% che identifica i pozzetti che contengono solo una singola cellula;
  • i reagenti per la preparazione della libreria sono distribuiti selettivamente, a discrezione dell’operatore, nei pozzetti contenenti singole cellule, identificati dal software CellSelect o selezionati manualmente dall’utente;
  • il software integrato consente agli utenti di progettare applicazioni NGS personalizzate ad alto rendimento o a cellula singola su scala di nanolitri.

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Approfondisci sul sito la tecnologia ICELL8: specifiche tecniche per il sistema ICELL8 cx, note applicative, webinar e altro ancora.

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Takara Single-cell RNA & DNA Sequencing

SMARTer NGS

Lo studio di singole cellule fornisce prospetti e informazioni uniche sullo sviluppo, sulla caratterizzazione della linea cellulare, all’eterogeneità dei tumori e sulla diversità delle cellule. Nonostante le preziose opportunità di questa metodologia, il processo di creazione di library omogenee per il sequenziamento è spesso complesso a causa della quantità limitata di RNA e DNA nelle singole cellule.

Le soluzioni SMARTer NGS sono state sviluppate per affrontare tali problematiche: la gamma di prodotti comprende strumenti di riferimento nel campo della preparazione di librerie di sequenziamento da singole cellule, da poche cellule e da input ultra-bassi sia di RNA che di DNA. I kit single-cell-RNA-seq si avvalgono della tecnologia proprietaria SMART (Switching Mechanism at 5’ end of RNA Template) per garantire una copertura completa dell’RNA, anche lavorando direttamente sulle cellule. I Kit single-cell DNA library preparation e whole-genome amplification di Takara si rifanno alla tecnologia SMARTer PicoPLEX, una tecnologia “quasi random primer” che è attualmente uno standard di qualità molto elevata per l’amplificazione dell’interno genoma.

Benefici e vantaggi:

  • Semplice e veloce: ottimizza la preparazione della tua library single cell per l’analisi RNA e DNA, rispettivamente con le soluzioni SMART e PicoPLEX
  • Alta riproducibilità: copertura attraverso l’intero genoma e trascrizione da singole cellule
  • Sensibilità elevata: rivelazione di trascrizioni più numerosa sul mercato, SNV e CNV
  • Facile da automatizzare: progettato per un’automazione intuitiva, ma altrettanto semplice anche per esperimenti di piccola e media entità.
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