Rielaborazione e analisi

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Rielaborazione e analisi2019-11-13T18:15:11+00:00

Analisi dati – SoftGenetics

SoftGenetics

SoftGenetics è produttore leader nel mondo di software per l’analisi automatica e l’interpretazione di dati genetici derivanti da diverse metodiche quali, ad esempio, sequenziamento Sanger e Next generation sequencing. Studiati per essere dei tool al completo servizio del ricercatore e dell’operatore diagnostico, riducono al minimo le competenze informatiche necessarie per la gestione dei dati. L’offerta comprende diversi software specifici che garantiscono la massima flessibilità applicativa in maniera da adattarsi ad ogni realtà di laboratorio.

Per ogni software è disponibile una versione di prova di 30 giorni.

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MaSTR™

MaSTR

MaSTR™ Enlightened Probabilistic Mixture Analysis Software

Il software MaSTRtm consente l’analisi Probabilistic Mixture,  compatibile con il sistema operativo Windows®, in maniera  facile e intuitiva, permettendo all’utente di compiere ricerche, convalide e applicazioni di casi.

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GeneMarker® HTS

GeneMarker HTS

GeneMarker®HTS (High Throughput Sequencing) mtDNA Analysis Software for Next Generation Sequencing Data

GeneMarker®HTS è un software che ottimizza il flusso di lavoro per le attività di ricerca medica e forense, in ambito mitochondrial DNA data analysis, da sistemi MPS come le piattaforme Illumina® e Ion Torrent®. Sviluppato in collaborazione con i laboratori leader su scala mondiale, l’interfaccia user-friendly di questo software permette una rapida analisi di diversi campioni.

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Mutation Surveyor®

Mutation Surveyor

Mutation Surveyor® DNA variant analysis of Sanger Sequencing software.

Questo software permette di eseguire differenti tipi di analisi di sequenze DNA, fino a 2000 files Sanger sequencing (.ab1,.RSD,.ESD & .scf), generati in 15 minuti dalle piattaforme Applied Biosystems Genetic Analyzers, MegaBACE e i sistemi Beckman CEQ per elettroforesi. Grazie alla sua tecnologia brevettata anti correlazione, Mutation Surveyor garantisce un’ eccellente precisione e sensibilità e bassi tassi di falsi positivi – negativi, nell’analisi delle varianti di DNA: SNPS, Indels, mutazioni somatiche, PCR sequencing, sequenze mitocondriali e progetti di resequencing.

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NextGENe®

NextGENe

NextGENe® 2nd Generation Sequence Analysis Software

NextGENe® è un programma dedicato all’analisi dei dati NGS generati da ION PGMtm, Illumina MiSeq, Roche Junior e da altri sistemi, ad alta capacità produttiva come Illumina® GA and HiSeq, Ion Protontm, Roche GS e Applied BioSystems SOLiDtm. L’interfaccia, semplificata e intuitiva, consente al biologo di operare con facilità evitando l’utilizzo di altri supporti bioinformatici e rimuovendo le complessità comuni a questo tipo di programmi (CLC Bio, LaserGene, DNASTAR, o altri programmi open source come: MAQ, SOAP, Top Hat, BWA e Bowtie). Il software contiene i moduli di analisi per: SNP/INDEL e varianti strutturali, Copy Number Variation (CNV), allineamento Whole Genome, splicing alternativo, RNA Seq, ChipSeq, e molto altro.

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Geneticist Assistant® NGS

Geneticist Assistant

Geneticist Assistant® NGS NGS Interpretative Workbench

Sviluppato in collaborazione con i dipartimenti del Laboratory Medicine, Information Technology and Health Science Research of Mayo Clinic, Geneticist Assistant NGS Interpretative Workbench è uno strumento online per il controllo, la visualizzazione, l’interpretazione di dati Next Generation Sequencing e specifici geni che permette di identificare varianti potenzialmente patogene, in determinate condizioni specifiche, come ad esempio il cancro al colon ereditario.

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GeneMarker®

GeneMarker

GeneMarker® The biologist-friendly software

GeneMarker® è un potente software per l’analisi del genotipo che, grazie alle nuove tecnologie applicate, è dotato di un’eccellente velocità, precisione e facilità di analisi. Il programma permette di ottimizzare l’analisi di applicazioni quali: AFLP, RFLP, analisi di microsatelliti, MLPA, MS-MLPA e molto altro.  Con la sua interfaccia “biologist-friendly”, GeneMarker® è una valida alternativa a Applied BioSystems Genotyper®, GeneScan®, GeneMapper®software, LiCor’s SAGA, MegaBACE® Genetic Profiler e Fragment Profiler o MRC Holland’s Coffalyser. Il Software è compatibile con tutti gli output dei migliori sistemi di sequenziamento come ABI Prism®, Beckman CEQ e le piattaforme MegaBACE®.

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GeneMarker® MTP

GeneMarker MTP

GeneMarker®MTP Multi-template processor

GeneMarker MTP®fornisce il potere di analisi di sei programmi GeneMarker, consentendo di ridurre i costi e rendere l’analisi dei frammenti di DNA più efficiente. GeneMarker MTP massimizza l’utilità del CE plate grazie alla possibilità di includere fino a 6 elementi chimici nella stessa piastra. La rapidità di GM MTP permette di processare sei piastre da 96 pozzetti l’una in 30 secondi. Le applicazioni di post-genotyping collegate sono: MLPA®, Trisomy/Aneuploidy, Cystic Fibrosis, Fragile X. LOH, MSI, STR Haplotype, ARMS®, SNaPShot® SNPs, AFLP, T-RFLP, Dendrogram Cluster Analysis, Relationship Testing, Database search, TILLING® e analisi di microsatelliti. GeneMarker MTP è castomizzabile con tutte le più importanti piattaforme di elettroforesi capillare (ABI®PRISM, Beckman-Coulter®, and MegaBACE®).

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GeneMarker® HID

GeneMarker HID

GeneMarker® HID human identity software

GeneMarker® HID human identity software è un ottimo programma per le analisi forensi di profilazione. Le capacità di questo software consentono: test parentali, ricerche nel database per i profili corrispondenti, analisi familiari, test di paternità e identificazione di persone scomparse; operazioni fondamentali ai fini dell’investigazione nella scena del crimine. GeneMarker HID è stato convalidato da laboratori forensi in tutto il mondo e ha tantissimi strumenti efficienti che permettono di velocizzare le risposte alle indagini.

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ChimerMarker®

ChimerMarker

ChimerMarker®, automated chimerism analysis software

ChimerMarker®, è un software di analisi automatizzato di chimerismo, veloce e preciso  che può essere utilizzato: per monitorare il livello di chimerismo nelle cellule staminali da trapianto allogenico e autologo (SCT), nelle cellule staminali ematopoietiche trapiantate ( HSCT ), nel trapianto di midollo osseo (BMT dopo l’attecchimento del trapianto di midollo osseo), e nelle cellule staminali del sangue periferico trapiantate (PBSCT) . Il programma fornisce una genotipizzazione accurata e rapida: identifica automaticamente il donatore e il ricevente tramite i picchi nei campioni post- BMT; calcola la percentuale di chimerismo e la qualità delle metriche per casi di singoli o doppi donatori, facilmente apprendibili grazie ai monitoraggi longitudinali post-BMT. Il software include funzioni per il confronto di campioni a differenti intervalli di tempo, per condurre studi longitudinali per il monitoraggio di ogni individuo e permette di creare un report completo dell’ analisi.

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JelMarker™

JelMarker

JelMarker™ Image Reading & Conversion Software

JelMarkertm è un potente software di lettura e conversione immagini sviluppato in risposta alla crescente domanda di programmi che hanno la capacità di analizzare la fluorescenza, chemiluminescenza e autoradiografia del gel di file immagini (specialmente da LI-COR’s 4300 DNA Analyzer e KODAK’s Image Station 4000R). JelMarkertm è un software di lettura di immagini autonomo, semplice e performante in grado di fornire informazioni accurate e chiare.

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